Molly es la historia de una chica que vive sola en un desierto post-apocalíptico y que posee habilidades sobrenaturales, y que se verá arrastrada a enfrentarse a un grupo de merodeadores para proteger a una niña.

Es el año 2027, ocho años después del primer brote de The Sickness, un virus altamente contagioso, adaptativo y letal. El mundo ahora está dirigido por una corporación farmacéutica llamada The Company, que distribuye un tratamiento para el virus pero cobra un alto precio por él, lo que pone a la mayoría de las personas en un estado de pobreza y dependencia.

El joven Cobain, de 15 años, intenta que su madre Mia cambie su estilo de vida destructivo. Cuando ella se niega, Cobain empezará a hacerse cargo de la situación.