Haiji était un coureur d'élite, mais n'a pas participé à une compétition en raison d'une blessure passée. Il rencontre ensuite un autre coureur d'élite, Kakeru, qui a également quitté la course, mais qui a été provoqué par un différend. Leur rencontre inspire les deux jeunes hommes à courir à nouveau, Haiji choisissant le légendaire "Hakone Ekiden" (course de relais longue distance). La course nécessite une équipe de 10 membres alors Haiji et Kakeru en recrutent 8 autres (dont certains n'ont jamais couru auparavant). Au sein de ce groupe improbable de coureurs, un lien se forme à travers leur entraînement et la conviction qu'ils peuvent accomplir l'impossible.

Unos extraños meteoritos caen alrededor de todo el mundo. Dichas rocas parecen tener algo especial por lo cual seres extraños aparecen para tomar lo que hay de ellos. Los Siete Riders Legendarios intentan defender lo que hay en ese lugar, pero no pueden y la Organización X toma poder sobre eso. A la vez, Eiji tiene que volver a la acción ya que un rider del futuro ha llegado para eliminar a todos los riders. Por su parte, Gentarou y sus amigos reciben la visita de una extraña chica. Sus caminos se cruzarán junto con el del detective W .